胃缺如或错位：若在超声或MR检查过程中（20分钟左右）胎儿胃持续不显影，要考虑有否胎儿食管闭锁、吞咽紊乱、先天性膈疝胎儿胸腔胃等可能；胃和心脏在胎儿左侧，出现在右侧时多为内脏反位。
十二指肠狭窄与闭锁：在MRI上典型的征象为：双泡征，系扩张的胃和十二指肠近段形成，在T2加权像的轴位和冠状位显示最佳。十二指肠闭锁与21-三倍体有明显的关联性。
小肠闭锁或梗阻：超声判断肠梗阻主要根据肠腔扩张，但对梗阻部位较难确定，而MRI可对梗阻的部位、胎粪性假囊肿及小肠多段梗阻都可很好显示。小肠闭锁近段肠管扩张，在T1WI呈低信号、T2WI呈高信号，而在梗阻的末段肠管，其内充满胎粪，在T1WI呈高信号、T2WI呈低信号。
胎粪性腹膜炎：在产前，胎儿肠管穿孔可导致无菌性化学性腹膜炎，点状钙化的胎粪可散布到整个腹部，超声较MR更容易发现钙化。若穿孔的肠管封闭形成胎粪性假囊肿，并可增大，在T2WI呈高信号，其内胎粪在在T1WI可呈高信号。提示严重的胎粪性腹膜炎四大征象：胎儿肠管肿胀、大的囊状肿块，腹水及羊水过多。
腹水：胎儿腹水可以单独存在，与水肿、感染、肿瘤，或胃肠道、泌尿生殖道穿孔相关。在T2加权像，自由漂浮的肠管在高信号羊水中衬托显示。
 肝脾畸形：胎儿肝脏异常最常见的表现是钙化，往往与肿瘤、感染和血管病变相关，超声较MR更易发现小钙化。胎儿脾脏畸形在超声较难发现，多脾，与异位症相关，产前MR检查可发现。
血色沉着病: 血色沉着症可利用非侵袭性MRI BOLD (T2﹡) 技术诊断。此时，肝脾均表现为低信号。
肝肿瘤：MR可在产前诊断，可发现肿瘤的范围和周围病变，小的肝脏病变在超声较MR更易发现。